رغم التشابه في أنشطة مجلس الغرف السعودية والغرف التجارية غير أن ثمة العديد من الاختلافات والفروقات في عمل كل منهما ويتضح ذلك من خلال التالي:
- مجلس الغرف السعودية هو المظلة الوحيدة والممثل الشرعي لكل قطاع الأعمال السعودي بمختلف فئاته وقطاعاته ومناطقه في حين تمثل الغرف التجارية مصالح قطاع الأعمال في المناطق التي توجد بها سواء في الرياض أو جدة أو الشرقية وغيرها.
- مجلس الغرف السعودية هو الكيان الذي يرعى ويمثل مصالح قطاع الأعمال السعودي والغرف التجارية داخلياً وخارجياً من خلال مختلف الأنشطة ومن خلال عضويته في المنظمات المحلية والدولية.
- يتسع سقف القطاعات الاقتصادية التي يمثلها ويخدمها مجلس الغرف السعودية من خلال 32 لجنة وطنية قطاعية كما للمجلس حق إنشاء لجان جديدة حسب ما تقتضيه مصلحة الاقتصاد الوطني وتشارك الغرف التجارية من خلال لجانها المختصة في اللجان الوطنية بالمجلس إلي جانب الخبراء والمختصين.
- ينفرد مجلس الغرف السعودية بوجود كيان شامل لخدمة علاقات المملكة الاقتصادية مع الشركاء التجاريين في مختلف دول العالم من خلال 31 مجلس أعمال سعودي أجنبي مشترك.
- يقدم مجلس الغرف السعودية خدمات حصرية في عدد من المجالات من خلال مركز الترقيم السعودي (الباركود) ، ومركز غرفة التجارية السعودية التابعة لغرفة التجارة الدولية بباريس ولجنة تطوير التجارة الدولية ومركز المنشآت العائلية والصغيرة ومركز المعلومات والبحوث الاقتصادية.
- يضطلع المجلس بالدور الرئيسي والمحوري في المشاركة في صياغة الأنظمة والقرارات التي تنظم وتخدم عمل القطاع الخاص السعودي وذلك من خلال عضوية المجلس في اللجان المختلفة ومجلس الشورى وهيئة الخبراء.
- تختلف آليات العمل ما بين مجلس الغرف السعودية والغرف التجارية حيث يعمل المجلس من خلال نظام الأمانات العامة والمراكز المتخصصة كالأمانة العامة للشئون الخارجية والأمانة العامة للشئون الاقتصادية والأمانة العامة لشئون التوطين وغيرها في حين تعمل الغرف بنظام الإدارات المتخصصة.